Cinéma :
On le voit apparaître sous le pseudonyme d'Oprah Noodlemantra lors d'une publicité que diffuse un poste de télévision, dans le film La Fin de Freddy : L'Ultime cauchemar (1991).
En 1998 il apparait dans son propre rôle et dans celui de William Blake dans le film L.A. Without a Map de Mika Kaurismäki.
En 2004 il apparait dans le film Ils se marièrent et eurent beaucoup d'enfants de Yvan Attal.
En 2011 il apparait dans le film Hugo Cabret de Martin Scorsese dans le rôle de Monsieur Rouleau. Alors que les enfants marchent dans la rue, un homme dessine sur le trottoir.



Télévision :
Il interprète son propre rôle en 1999 dans un épisode de la série télévisée britannique The Vicar of Dibley et en 2000 pour un sketch de l'émission de divertissement The Fast Show.



Séries d'animation :
Il double le personnage de Yogi Victor dans la version originale des Rois du Texas (King of the Hill), et interprète son propre rôle dans la troisième saison d'American Dad (épisode Tearjerker - 2008). Il double également Jack Kahuna Laguna, Le Roi du Surf dans un épisode de Bob L'éponge (La Vague parfaite - 2009)

Enregistrements :
- En 1994 Johnny Depp est à la guitare sur le morceau That Woman's Got Me Drinking de l'album The Snake de Shane MacGowan.
- Il enregistre en 1995 l'album P en compagnie de Gibby Haynes, Steve Jones, Flea, Chuck E. Weiss et Sal Jenco.
- Il est à la guitare slide sur la chanson Fade In-Out d'Oasis figurant sur l'album Be Here Now sorti en 1997. Il est invité par le groupe à rejouer l'année suivante sur le titre Fade Away.



- En 2000, il compose les musiques de 2 chansons sur l'album Bliss de sa compagne Vanessa Paradis : St Germain et Bliss.
- Il joue également trois titres à la guitare dans le film Le Chocolat de Lasse Hallström en 2001, et participe à la bande-originale du film Il était une fois au Mexique... Desperado 2 en 2003 en composant un titre (Sands Theme) crédité sous le pseudonyme de Tonto's Giant Nuts.




- Vanessa Paradis participe à un album-hommage à Alain Bashung, sorti en avril 2011, dans lequel elle reprend la chanson Angora dont la réalisation, les arrangements et les guitares sont signés Johnny Depp.
- En novembre 2011, le couple reprend en duo la chanson Ballade de Melody Nelson, de Serge Gainsbourg et Jane Birkin sur l'album To Gainsbourg from Lulu réalisé par Lulu Gainsbourg.
- En 2012 il joue de la guitare sur la reprise de You're So Vain de Carly Simon, chanson bonus du 8e disque de Marilyn Manson, Born Villain.
- En 2013 il compose la musique du titre New year figurant sur l'album de Vanessa Paradis Love Songs.




Scène :
- Il rejoint Vanessa Paradis sur la scène de l'Olympia, le 25 mars 2001 lors de la dernière représentation des concerts de la chanteuse et l'accompagne à la guitare sur une reprise de Jacques Dutronc : Fais pas ci, fais pas ça.
- Il accompagne Eddie Vedder et Patti Smith lors du concert Voices For Justice à Little Rock le 28 août 2010.
- Fan du chanteur de hard rock Alice Cooper, il rejoint ce dernier à la guitare sur deux titres lors d'un concert le 28 juin 2011.
- Le 11 avril 2012, il accompagne à la guitare son ami Marilyn Manson en concert à Los Angeles, sur deux chansons : Sweet Dreams et The Beautiful People.



Clips :
- Johnny Depp apparait en 1991 dans le clip de Tom Petty, Into The Great Wide Open.
- En 1994, il tourne dans le clip de la chanson de Shane MacGowan : That Woman's Got Me Drinking.
- On le retrouve en 2006 dans le clip posthume de Johnny Cash God's Gonna Cut You Down, en compagnie d'une trentaine d'autres artistes.
- En 2008 et 2010, il apparait furtivement dans les clips L'Incendie et Il y a de sa compagne Vanessa Paradis qu'il a réalisé.
- En 2012, il tourne au côté de Natalie Portman dans le clip My Valentine de Paul McCartney, chanson issue de l'album Kisses on the Bottom sorti la même année. Dans ce clip, les deux acteurs interprètent le texte de la chanson en langage des signes.